ニジニー・ノヴゴロド日本センターは2001年10月に独立非営利法人 「貿易経済交流発展のための日本センター」の支部として設立されました。
現在日本センターはモスクワ、サンクトペテルブルク、ニジニー・ノヴゴロド、ハバロフスク、ウラジオストク、ユジノサハリンスクの六都市に設置されたセンターで構成されています。
日本センターの活動は、2003年6月29日付「ロシア連邦において実施される改革への技術支援のための日本センターのロシア連邦領域における活動に関する日本国政府とロシア連邦政府との間の覚書」やその他の政府間の文書に従い実施されております。
ANO「日本センター」は、ロシアの法令に従い登記されたロシア現地法人で、定款に基づき活動しています。当センターの活動は、在ロシア日本国大使館を経由して日本国政府より予算を充てられています。「日本センター」は、ロシアの専門家の育成及び教育基盤の役割を果たしています。